MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW2

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015603	CAG	2	6	26	31	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015603	TCA	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015603	ACA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015603	ATA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015603	T	10	10	2640	2649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015603	AGG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015603	GGA	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015603	GTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015603	AAC	2	6	16122	16127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015603	AGCAA	3	15	16138	16152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015603	A	6	6	17544	17549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015603	CCG	2	6	17556	17561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015603	CCTCA	2	10	17801	17810	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015603	CTT	2	6	17842	17847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015603	ATA	2	6	17888	17893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015603	ATG	2	6	17911	17916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015603	CTGGT	2	10	17952	17961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015603	TA	3	6	17965	17970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015603	ATA	2	6	17988	17993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015603	T	6	6	21754	21759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015603	TAA	2	6	21810	21815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015603	CAA	2	6	21820	21825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015603	TGAA	2	8	21829	21836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015603	AGA	2	6	21857	21862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015603	T	7	7	21874	21880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015603	AAT	2	6	21895	21900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015603	A	6	6	22145	22150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015603	AGT	2	6	22157	22162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015603	A	6	6	22185	22190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015603	T	6	6	22196	22201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015603	ATTC	2	8	22206	22213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015603	A	7	7	22214	22220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015603	ATT	2	6	22224	22229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015603	GAC	2	6	22924	22929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015603	ACT	2	6	22971	22976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015603	ATCTA	2	10	23009	23018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015603	A	6	6	23023	23028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015603	ATA	2	6	23052	23057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015603	T	6	6	23058	23063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015603	T	6	6	23086	23091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015603	A	6	6	23124	23129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015603	AT	3	6	23143	23148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015603	TAA	3	9	25559	25567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015603	ATTAT	2	10	25605	25614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015603	CAA	2	6	25620	25625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015603	A	7	7	25627	25633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015603	GAT	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015603	AGG	2	6	25645	25650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015603	AAG	2	6	25814	25819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015603	TGC	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015603	T	7	7	25869	25875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015603	GTC	2	6	27528	27533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015603	GAC	2	6	27540	27545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015603	CCA	3	9	27638	27646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015603	TAAA	2	8	27674	27681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015603	TAA	2	6	28060	28065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015603	A	6	6	28064	28069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015603	T	6	6	28086	28091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015603	A	6	6	28104	28109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015603	TAA	2	6	28110	28115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015603	TCT	2	6	28126	28131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015603	GAAA	2	8	28165	28172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015603	TAAC	2	8	28191	28198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015603	T	6	6	28238	28243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015603	TTTA	2	8	28253	28260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015603	TGTA	2	8	28285	28292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015603	AAT	2	6	28298	28303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015603	A	6	6	29653	29658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015603	T	6	6	29693	29698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015603	AAT	2	6	29710	29715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015603	AAT	2	6	30030	30035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015603	TATT	2	8	30089	30096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015603	TTA	2	6	30100	30105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015603	ACA	2	6	30124	30129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015603	AG	3	6	30140	30145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015603	A	6	6	30150	30155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015603	CAA	2	6	30217	30222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015603	CTT	2	6	30234	30239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015603	A	6	6	30266	30271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015603	AAG	2	6	30280	30285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015603	TAA	2	6	30288	30293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015603	GAT	2	6	30299	30304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015603	TAG	2	6	30305	30310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015603	T	6	6	30337	30342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015603	ATC	2	6	30351	30356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015603	TA	3	6	30649	30654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015603	CGA	3	9	30687	30695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015603	TGAC	2	8	30697	30704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015603	TGT	2	6	30721	30726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015603	CTC	2	6	30765	30770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015603	T	6	6	30813	30818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015603	T	6	6	30827	30832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015603	TGG	2	6	30836	30841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015603	AATT	2	8	30889	30896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015603	GAA	2	6	30908	30913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015603	GAA	2	6	30917	30922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015603	AATT	2	8	36069	36076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015603	AAG	2	6	36082	36087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015603	CTT	2	6	36102	36107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015603	T	6	6	36106	36111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015603	TGC	2	6	36144	36149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015603	TG	3	6	36177	36182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015603	GGCT	2	8	36256	36263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015603	AGG	2	6	36276	36281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015603	ATT	2	6	36365	36370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015603	CA	3	6	36398	36403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015603	TAT	2	6	37414	37419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015603	CTTAA	2	10	37429	37438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015603	ATT	2	6	37452	37457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015603	GTTAT	2	10	37460	37469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015603	AGAA	2	8	37503	37510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015603	TA	3	6	40214	40219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015603	TTAAG	2	10	40247	40256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015603	TAAAA	2	10	40316	40325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015603	TAT	3	9	40402	40410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015603	T	6	6	40431	40436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015603	TAC	2	6	40974	40979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015603	ATAGCT	2	12	40991	41002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015603	TAA	2	6	41015	41020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015603	TTTA	2	8	41039	41046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015603	ACA	2	6	41101	41106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015603	AG	3	6	41117	41122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015603	A	6	6	41127	41132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015603	CAA	2	6	41193	41198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015603	CTT	2	6	41210	41215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015603	A	6	6	41242	41247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015603	AAG	2	6	41256	41261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015603	TAA	2	6	41264	41269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015603	GAT	2	6	41275	41280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015603	TAG	2	6	41281	41286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015603	T	6	6	41313	41318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015603	ATC	2	6	41327	41332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015603	TA	3	6	41625	41630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015603	CGA	3	9	41663	41671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015603	TGAC	2	8	41673	41680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015603	TGT	2	6	41697	41702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015603	CTC	2	6	41741	41746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015603	T	6	6	41789	41794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015603	T	6	6	41803	41808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015603	TGG	2	6	41812	41817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015603	TTGT	2	8	41834	41841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015603	AAC	2	6	41870	41875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015603	A	6	6	41899	41904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015603	AAC	2	6	41952	41957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015603	A	7	7	41961	41967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015603	T	6	6	42003	42008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015603	A	6	6	42129	42134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015603	TGG	2	6	42141	42146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015603	T	6	6	42154	42159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015603	C	6	6	42392	42397	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_015603	G	6	6	42418	42423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015603	TTA	2	6	42424	42429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015603	A	6	6	42440	42445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015603	ATTA	2	8	42502	42509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015603	TTA	2	6	42526	42531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015603	A	7	7	42543	42549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015603	AGT	2	6	42552	42557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015603	AT	3	6	42565	42570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015603	AT	3	6	42576	42581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015603	AT	3	6	42587	42592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015603	AT	4	8	42601	42608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015603	TGG	2	6	42626	42631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015603	TGG	2	6	42978	42983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015603	CAT	2	6	43040	43045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015603	GGT	2	6	43075	43080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015603	T	6	6	43423	43428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015603	A	6	6	43435	43440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015603	ACT	2	6	43476	43481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015603	AGA	2	6	43526	43531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015603	TTAAA	2	10	43613	43622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015603	A	6	6	43640	43645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015603	AATT	2	8	43653	43660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015603	AAG	2	6	43859	43864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015603	CTT	2	6	43890	43895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015603	T	6	6	43894	43899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015603	A	6	6	43935	43940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015603	T	6	6	43941	43946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015603	GCTT	2	8	43967	43974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_015603	A	6	6	43979	43984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015603	T	6	6	44073	44078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015603	T	6	6	44080	44085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015603	CTT	2	6	44287	44292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_015603	TGA	2	6	44296	44301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015603	ACT	2	6	44344	44349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_015603	CAA	2	6	44372	44377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_015603	GTA	2	6	44904	44909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015603	GTA	3	9	44915	44923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015603	AAAG	2	8	44924	44931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015603	ACC	2	6	45975	45980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
191	NC_015603	AAT	2	6	46221	46226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015603	AT	3	6	46242	46247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.